泛素一蛋白酶體途徑（ubiquitin-proteasome pathway）是細胞內一個重要的蛋白質降解調節(jié)系統(tǒng)。通過對底物蛋白的多聚泛素化并經蛋白酶體降解，可以影響或調節(jié)多種細胞活動，包括：基因轉錄、細胞周期調節(jié)、免疫反應、細胞受體功能及腫瘤生長、炎癥過程等。該途徑也是一種動態(tài)的蛋白質雙向修飾調控系統(tǒng)，在體內由泛素連接酶系統(tǒng)（E1-E2-E3）對底物進行泛素化修飾，去泛素化酶（DUB）家族負責通過水解泛素羧基末端的酯鍵、肽鍵或異肽鍵，將泛素分子特異性的從鏈接有泛素的蛋白質或者前體蛋白水解下來，起到去泛素化的作用，對蛋白降解進行反向調節(jié)，從而影響蛋白質的功能。
去泛素化酶
去泛素化酶是一類數(shù)量很大的蛋白酶家族，人類基因組編碼大約100個去泛素化酶，主要分為五個家族，分別是泛素羧基末端水解酶（UCH）家族，泛素特異性蛋白酶（USP/UBP）家族，Otubaim（OTU）家族，Josephin結構域蛋白家族及JAMM家族。
1.泛素羧基末端水解酶家族（ubiquitin C-terminal hydrolases，UCHs）
UCHs屬于半胱氨suan蛋白酶。通常是小分子蛋白，已發(fā)現(xiàn)UCHL-1、-2、-3、-4、-5等分子。它們作用的底物通常也是一些分子量較小的多肽。UCHs可以通過裂解C末端76位甘氨suan，將泛素分子從小的多肽底物上釋放出來。UCHs活性位點上的狹窄裂隙和環(huán)狀結構直徑的限制在一定程度上起到了特異性識別底物的功能，阻止了它對一些大分子泛素化蛋白的結合和催化。
2.泛素特異性加工酶家族（ubiquitin-specific processing enzymes，UBPs 或 ubiquitin-specific proteases，USPs）
該家族是目前已知的去泛素化酶中成員最多，且結構zui ju多樣性的一類，亦屬半胱氨suan蛋白酶，包括Ubp-M、UBP41、UBP4、HAUSP、ISOT1等。這些酶分子都含有兩個短而保守的片段即賴氨酸盒和組氨suan盒，序列中具有起催化作用的三聯(lián)殘基，即半胱氨suan、組氨suan、天冬氨酸/天冬酰胺，能將泛素分子從大的蛋白上移除。
3.卵巢腫瘤相關蛋白酶（ovarian tumor-related proteases，OTU）
通過晶體結構分析發(fā)現(xiàn)這類蛋白酶雖然在氨基酸序列上與其他家族的去泛素化酶不同，但也具有三聯(lián)催化活性位點（Cys，His，Asp）組成的核心結構域，與UBP家族蛋白有很大相似性，并且已證明能起到去泛素化的作用。
4.MJD去泛素化酶家族
Machado-Joseph疾病相關蛋白Ataxin-3被研究得較為清楚，它是個與神經退化紊亂相關的蛋白。人類的Josephin家族蛋白有4個，它們的結構類似于UCH去泛素化酶家族，分別是Ataxin-3、Ataxin-3L、Josephin-1和Josephin2。其中的Ataxin-3是個半胱氨suan蛋白酶，它可以結合K48、K63方式連接的泛素鏈，但是對K63方式連接的泛素鏈更特異。Ataxin-3和Ataxin3L在氨基酸序列上是85%同源的，以相似的方式折疊，但結合Ub的方式卻大不同。
5.JAMM蛋白酶家族
這一類去泛素化酶的代表是POH1，酵母細胞中的同源物稱為Rpn 11。這是一類能結合泛素化蛋白上泛素分子的金屬蛋白酶，具有MPN序列，或稱JAMM（Jab1/MPN domain associated metalloisopeptidase，Jab 1/MPN域相關金屬異肽酶）序列。這一序列含有較為保守的兩個組氟酸殘基和一個天冬氯酸殘基，它們與二價鋅離子共同構成催化中心。
